通风管路的维护主要应考虑室外和室内 2 部分运行的状况。
室外管路长期处于室外环境，管壁容易老化变形，尤其是 PP 管或玻璃钢管路因受管路内负压影响，上部大多会凹陷，表面容易沉积水和污垢，受冬季冰冻或夏季日光暴晒更易加速老化。 笔者所在实验室通过在室外管路表面包敷铝箔进行保护，使用 3 年后，外管表面光洁如新，密封情况良好，保护效果明显。排风系统长时间处于振动和负压状态，室外管路的接口处松动老化现象普遍，容易吸入雨水导致漏风失压和进水。 因此，日常检查维护中应加以关注。 外管入墙处是排风系统最容易安装出错之处，切忌在破墙开口时外低内高，防止管壁的雨水流入室内。尤其是南方台风多雨季节，室外大风和室内负压的双重作用，使雨水容易沿着外管壁顺流而下穿过管壁与墙体间的缝隙直接流入室内，导致室内管壁漏水如注，对实验室日常工作造成严重影响。室外管路还有一个需要特别关注的问题，即软接头部分的老化泄漏问题。为方便风管与风机部分的运作，常采用塑性材料连接的方式，但这种材料容易老化发脆，折皱处易破裂泄漏，导致排风管路负压损失，在维护保养过程中应及时更换排风管。
室内管路虽不像室外管路那样容易老化变质，但当管路长期处于振动和负压情况时，容易出现接口松动，从而引起废液渗漏和管路底部的积液问题。大部分通风系统施工单位只负责初次安装，很少考虑室内通风管路的维护保养，基本处于通风系统一旦安装，就一次性使用至事故报修甚至报废，需要重新设计安装的状态。 为此，为保证环境空气的清新和实验室人员的身体健康，相关人员必须对室内管路进行定期维护。 通风柜排出的酸或高沸点有机物经管路冷凝淤积或室外管路可能产生的雨水渗漏，必然会导致室内管路积液。曾有实验室为避免实验室废气味道重、排风口滴液或灰尘掉落等情形，干脆长期开启排风系统，造成整个实验室区域因负压过大而易吸引粉尘，大量浪费空调能源。 通风管路大多处于室内顶部，不适合直接用溶剂冲洗的方法，必要时应直接更换离通风柜出风口较近的室内管路，保证通风管路的排气畅通和室内空气的清新。
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